Det norske herrelandslaget opplyser om forfallet i en melding på Twitter.
Samtidig bekrefter de at det ikke hentes inn noen erstatter.
Forfallet kommer ikke som noen stor overraskelse. Da troppen ble presentert, uttalte landslagssjef Ståle Solbakken at Holmgren Pedersen var usikker.
– Vi er litt i trøbbel på backene. Birger Meling har spilt 20-25 minutter siden mai. Marcus Holmgren Pedersen er tvilsom. Det er ikke sikkert at han blir med i den første kampen. Det er litt uryddig på backene, sa Solbakken.
Norge skal spille to kamper i EM-kvaliken de kommende ukene. Først venter Skottland på Ullevaal 17. juni, før det blir ny hjemmekamp mot Kypros 20. juni.