Det var tett snøvær på søndagens klatreetappe, men etter nesten fem og en halv times hardkjør kunne Quintana juble for etappeseier og blå trøye.
Colombianeren gikk til angrep fem kilometer før mål, og ingen av konkurrentene klarte å holde følge.
Han trillet i mål 41 sekunder foran nederlandske Bauke Mollema, mens spanjolen Joaquim Rodríguez var 14 sekunder bak ham igjen.
To etapper før slutt leder Quintana i sammendraget, 39 sekunder foran Mollema.
Edvald Boasson Hagen kom langt bak under de svært vanskelige forholdene. Han tråkket inn til 51.-plass over ti og et halvt minutt etter vinneren. I sammendraget er nordmannen nummer 39, drøye elleve minutter bak Quintana. (©NTB)