En rapport fra fylkesmannen viser at ledelsen ved skolen ikke innfrir lovens krav til forsvarlig faglig, pedagogisk og administrativ ledelse.
Fylkesmannen mener at summen av disse forholdene er så stor at Utdanningsdirektoratet bør vurdere om det fortsatt er grunnlag for å godkjenne skolen med statstilskudd.
Fylkesmannens rapport viser at det ikke er rektor som er skolens leder, men pastor Glenn Rasmussen i Skjærgårdsmenigheten. Verken den formelle eller reelle lederen ved skolen har kompetanse innen skoleledelse, ifølge rapporten.
Fylkesmannen refser også skolens økonomi og mener den er sammenblandet. Statstilskudd og elevinnbetaling er ikke kommet elevene til gode slik loven krever, og det er vanskelig å beregne hvor mange penger som er overført til rektor og til menigheten, ifølge fylkesmannen.