Siden fredag i forrige uke har det falt opp mot 1.000 millimeter regn på den sørlige øya Kyushu. Meteorologene har varslet ytterligere 300 millimeter i enkelte områder det neste døgnet, ifølge allmennkringkasteren NHK.
Myndighetene har nå beordret rundt 1 million mennesker i områdene Kagoshima og Miyazaki til å evakuere, ifølge Reuters. Ytterligere 930.000 mennesker har blitt rådet til å evakuere.
Det er registrert flere mindre jordskred under regnværet som nå pågår, men det er så langt ikke rapportert om skadde mennesker.
Landets statsminister Shinzo Abe har bedt innbyggerne i de rammede delene av landet om å evakuere tidlig for å forhindre tap av liv.
Statsministerens regjering fikk i fjor sommer kraftig kritikk for å ha reagert for sent da jordskred og flom utløst av kraftig regnvær tok livet av over 200 mennesker, i det som var den verste naturkatastrofen i landet på 36 år.