Statsråd Valgerd Svarstad Haugland avviser at utnevnelsen er politisk betinget, og sier hun har vektlagt det kirkelige votum. Det er likevel ingen hemmelighet at Kvarme har vært KrFs kandidat. Det var også ventet at partiet ville få gjennomslag for å utnevne ham etter det sviende nederlaget da sentrumsregjeringen utnevnte Gunnar Stålsett for sju år siden.
Når Kvarme er omstridt handler det mest om hans syn på homofili. Mange er redd for at han vil gjøre kirken mindre inkluderende enn sin forgjenger Stålsett. Kvarmes tilhengere mener det er skapt et vrengebilde av ham i prosessen som har pågått de siste ukene. Nå bør han få mulighet til å vise at han vil ha en åpen og inkluderende kirke hvor menneskevedet holdes høyt.