Verdens helseorganisasjon WHO sier at de nye tilfellene viser at polioviruset har vært i omløp i delstaten Borno i fem år, uten å ha blitt oppdaget.
Oppdagelsen er et alvorlig tilbakeslag etter at Nigeria var erklært poliofritt i oktober i fjor.
Fordi ekstremistbevegelsen Boko Haram jevnlig utfører angrep i Borno, har det vært vanskelig å sende helsepersonell til området der de to barna er.
WHO og amerikanske CDC står overfor massive utfordringer når det gjelder å vaksinere millioner av barn i et område der FN stanset all bistand etter at en humanitær kolonne ble angrepet i forrige måned.
Det at Nigeria ble fjernet fra listen over land med polio, innebar at Afrika var blitt poliofritt. Bare Afghanistan og Pakistan sto igjen før Nigeria igjen er oppført på listen. (©NTB) (©NTB)