29-åringen haltet av banen etter bare 16 minutter under lørdagens kvartfinale mot Italia, og søndag melder tyske Kicker at en lyskeskade setter en stopper for Juventus-spillerens videre EM-eventyr med Tyskland.
Khedira trøblet også med lysken i åttedelsfinalen mot Polen, men en duell med Giorgio Chiellini ble altså skjebnesvanger for midtbanespilleren.
Det er dårlig nytt for Joachim Löw og Tyskland som allerede må klare seg uten Mats Hummels som er ute med karantene.
Tyskland møter vinneren av søndagens kamp mellom Frankrike og Island i sin semifinale i EM. Portugal og Wales møtes i den andre. (©NTB)