Keane kom i krangel med reservekeeper Alan Kelly og keepertrener Paddy Bonner etter at keeperne slapp å være med på en five-a-side-kamp på slutten av treningen.
Keane skal også ha kommet i klammeri med trener Mick McCarthy da sjefen prøvde å gripe inn.
Dårlig kne
Keane skal ha sagt at personlige grunner i tillegg til en kneskade var grunnen til at han ville hjem på neste fly.
Keane var så fast bestemt på å reise hjem at trener McCarthy tirsdag ringte Celtics Colin Healy for å si fra at Healy var tatt ut som Keanes erstatter.
Trente som vanlig
Men onsdag trente Keane med laget, og McCarthy hevdet Keane ville bli med laget resten av VM.
— Roy er helt i orden. Han har ombestemt seg, og det er jeg meget fornøyd med. Han bør spille i VM siden han er en av verdens beste spillere, sier McCarthy.